Cara, sou contador e trabalho com consultoria tributária.
Contador acabar "deixando pra lá" que os clientes utilizem suas contas pessoais, mas na contabilidade existe o princípio da entidade, que exige a discriminação entre o patrimônio pessoal e da empresa.
Quando você é PJ, de modo geral, há uma proteção ao seu patrimônio pessoa física que, caso você não cumpra, pode haver a desconsideração da personalidade jurídica e em caso de responsabilidade, pode afetar o seu patrimônio pessoal, entre outros impactos (se tiver advogado, ajuda nos detalhes, por favor). Mesmo sem funcionários, entendo que no caso de processo ou cobrança, isso poderia alcançar seu patrimônio pessoal. O ideal é sempre fazer o certo.
Fora que a movimentação no seu patrimônio pessoal poderia afetar com as despesa/faturamento da empresa.
Se você não entendeu os motivos que ele deu, acho que vale perguntar detalhadamente pra entender.