Entendo a dor em vender as ações, mas espero que seja uma ótima oportunidade.
O imposto devido é somente sobre o Lucro que você obteve, comparando o preço de venda com o teu PM.
Ex: Você comprou ações com um custo de 19k, e as vendeu por 21k, pagaria o IR sobre estes 2k de valorização.
Tanto é que em alguns casos, é possível utilizar prejuízos anteriores para abater este lucro tributável. Mas não vou prolongar no assunto.
Sobre isto, é considerado o somatório das vendas dentro do mês para o limite de 20k. Ou seja, se você vendeu parte no início do mês, outra parte no meio, e mais um pouco no final, caso a soma das vendas ultrapasse 20k, deve observar o pagamento de IR (E se vender tudo em uma única tacada, da na mesma). O que pode ser feito, é vender um valor inferior a 20k em um mês, e outro valor no mês seguinte, não ultrapassando assim o limite.