Newton, qual seria o seu objetivo com esse mestrado?
Mestrado e doutorado é um caminho interessante para quem quer seguir na carreira acadêmica, lecionar em faculdades/universidades e também para planos de carreira (dependendo da empresa ou se você entrar ou já for servidor público).
É bem possível você entrar em uma universidade federal e conversar com os professores sobre os ajustes de horários, e também há a possibilidade de você entrar como aluno especial e verificar se consegue ajustar sua rotina juntamente com um mestrado.
Agora, se o seu objetivo é adquirir mais conhecimento como profissional e ter mais currículo... Seria melhor ir atrás de certificações que valham a pena dentro da sua área (banco de dados, segurança da informação,...)
Caso seja apenas realização pessoal, concordo com o colega que falou para você se organizar e fazer isso mais pra frente.