Boa tarde,
Lendo sua primeira frase e onde você trabalha, eu já diria para ir direto para o mestrado, ainda mais se tratando de Embraer, aviões e engenharia pesada aplicada.
Em Gestão de projetos pode ir fazendo cursos básicos ou, de repente, tentar falar ou trabalhar com alguém no seu trabalho sobre (como é, o que acha, vantagens e desvantagens).
Mestrado sempre vai lhe levar a ser especialista técnico ou acadêmico, já gestão de projetos pode lhe levar a cargos e contatos maiores para crescimento, principalmente, financeiro na área. Ás vezes, é questão de autoconhecimento e opiniões de como seus colegas/supervisores lhe enxergam.
2 anos de formada ainda é cedo, você terá bastante engenharia e desafios pela frente. Neste nosso ramo, 10% é técnico e o resto são relacionamentos interpessoais, sua comunicação e postura profissional no ramo.